使用日誌縮放的第一個用於分析凝膠(瓊脂糖和頁面)頻段的Android應用
*與Android OS更改一致,請使用ES File Explorer訪問本地文件,該文件將紮根驅動器/SD卡。您將需要進入ES File Explorer首先執行生根。請注意,由於Android和Dropbox的變化,Dropbox支持將被刪除。
這是第一個允許您使用標記自動生成的日誌圖分析凝膠(瓊脂糖和頁面)頻段的Android應用。它允許自動檢測和加載以供將來使用。使用Gabor過濾器,此應用程序允許用戶自動改善頻段的檢測。對於質量差的圖像,用戶可以單擊可以手動在所需的頻段上繪製一個框或單擊圖像以確定指定位置。
圖像可以從畫廊或Dropbox加載,從而非常方便。最好的圖像是通過掃描儀生成的圖像,但可以通過從移動相機拍攝的照片來發揮作用。
照片應在帶有凝膠的直接飛機上拍攝。
此應用的功能包括:
1)瓊脂糖或頁面的規範。
2)頁面標記帶的顏色識別。
3)高級成像過濾器-Garbor。
4)如有必要,可以使用自定義用戶輸入的自動圖像處理。
5)為未來的便利而節省圖像處理的設置。
6)使用相同的標記時節省標記以實現未來的便利性。
7)基於簡單和按鈕的用戶界面。
8)頻段自動檢測。
9)簡單的用戶定義邊界框。
10)自動生成標記的日誌圖。
11)用戶定義特定頻段的位置。
12)與多個平板電腦和智能手機的景觀和肖像視圖兼容。
13)與分析的凝膠和日誌圖形智能手機和平板電腦的屏幕截圖功能的兼容性。
14)在凝膠圖像中顯示的讀數帶有突出顯示的框和計算的帶尺寸。
15)在分析之前,圖像的裁剪功能。
16)編輯功能以刪除不需要的頻段。
17)用於標記和樂隊的不同彩色盒子。
18)簡單直接訪問圖像圖像庫。
19)與SYBR綠色的ETBR瓊脂糖凝膠分析兼容。
20)直接攝像機訪問。
將此應用用於出版物的好處
1)為您的凝膠分析帶來更高的準確性,而不是依靠近似值。
2)增值增加了出版物和報告。
3)對科學專業的學生有用的教學工具。
4)簡化分析,減少人為錯誤和主觀性 - 您現在可以信任受訓者和經驗不足的員工報告的價值!
5)在使用智能手機/平板電腦的GO分析中。
6)自動分析 - 不需要圖形紙和繁瑣的繪圖。
7)該應用是免費的!
8)該應用程序是獨立的,不需要Internet訪問(除非進行Dropbox分析)。
Android 6用戶可以從本地“圖像”畫廊獲取圖像。較早的Android版本用戶將支持Dropbox。這是由於Android 6的變化所致,並且無法控制。
要使用的說明,請在https://www.youtube.com/watch?v=chlzhy8d_ka&feature=youtu.be上觀看視頻。
在http://tinyurl.com/gelapp上以PDF的價格使用USERGUIDE
*最新手機,例如三星Note 8可能會在節省相機方面存在問題。如果存在此類問題,請使用畫廊。
引用,請使用:
Sim,Jz。 *,Nguyen,Pv。 *,Lee,Hk。 ,Gan,Ske。 (2015)。 Gelapp:移動凝膠電泳分析儀。自然方法應用筆記。 doi:10.1038/an9643
或直接在App Store中的軟件
SIM,JZ,NGUYEN,PV,GAN,SKE(2014)GELAPP :DNA和PROT GEL ANALYZER v1.2。 [移動應用程序軟件]。取自https://play.google.com
該應用程序是新加坡科學,技術和研究機構,生物信息學研究所轉化研究部抗體與產品開發實驗室的產品。
創作者是:Sim Jia Zhi先生,Nguyen Phi Vu先生和Samuel Gan博士。
(Poly Intern)(研究官)(助理首席研究員)