ログスケーリングを備えたゲル(アガロースとページ)バンドを分析するための最初のAndroidアプリ
*Android OSの変更に沿って、ESファイルエクスプローラーを使用してローカルファイルにアクセスしてください。最初にルート化を実行するには、ESファイルエクスプローラーに行く必要があります。 AndroidとDropboxの変更により、Dropboxサポートは削除されていることに注意してください。
これは、マーカーから自動的に生成されたロググラフを使用して、ゲル(アガロースとページの両方)バンドを分析できる最初のAndroidアプリです。これにより、将来の用途の自動検出と読み込みが可能になります。 Gaborフィルターを利用するこのアプリにより、ユーザーは自動的にバンドの検出を改善できます。質の悪い画像の場合、ユーザーはクリックして、目的のバンドにボックスを手動で描画したり、画像をクリックして指定した場所を決定できます。
画像はギャラリーまたはドロップボックスからロードでき、非常に便利です。最高の画像はスキャナーを介して生成される画像ですが、モバイルカメラからよく撮影した写真で機能します。
写真は、ゲルとともに直接飛行機で撮影する必要があります。
このアプリの機能には以下が含まれます。
1)アガロースまたはページの仕様。
2)ページのマーカーバンドの色の識別。
3)高度なイメージングフィルター-Garbor。
4)必要に応じて、カスタマイズされたユーザー入力を使用した自動化された画像処理。
5)将来の利便性のための画像処理のための設定の節約。
6)同じマーカーを使用する場合の将来の利便性のためにマーカーを保存します。
7)シンプルでボタンベースのユーザーインターフェイス。
8)バンドの自動検出。
9)シンプルなユーザー定義の境界ボックス。
10)自動的に生成されたマーカーのロググラフ。
11)特定のバンドのユーザー定義の場所。
12)複数のサイズのタブレットとスマートフォンの風景とポートレートビューとの互換性。
13)出版物やレポート用の分析されたゲルおよびロググラフのスマートフォンとタブレットのスクリーンショット関数との互換性。
14)強調表示されたボックスと計算されたバンドサイズを備えたゲル画像に表示される測定値。
15)分析前の画像のトリミング機能。
16)機能を編集して、不要なバンドを削除します。
17)マーカーとバンド用のさまざまな色のボックス。
18)画像用の画像ギャラリーへの簡単な直接アクセス。
19)SYBR Green、ETBRアガロースゲル分析と互換性があります。
20)直接カメラアクセス。
出版物にこのアプリを使用することの利点
1)近似に依存するのではなく、ゲル分析に精度が向上します。
2)価値は出版物とレポートに追加されます。
3)科学の学生に有用な教育ツール。
4)合理化された分析、ヒューマンエラーと主観性の減少 - 研修生と経験の少ないスタッフによって報告された価値を信頼できるようになりました!
5)スマートフォン/タブレットを使用したGO分析。
6)自動分析 - グラフ紙と退屈なプロットの必要はありません。
7)アプリは無料です!
8)アプリは自己完結型であり、インターネットアクセスは必要ありません(Dropbox分析がない限り)。
Android 6ユーザーは、ローカル「画像」ギャラリーから画像を取得できます。以前のAndroidバージョンのユーザーは、Dropboxのサポートを提供します。これは、Android 6の変化によるものであり、私たちの制御を超えています。
使用する手順については、https://www.youtube.com/watch?v=chlzhy8d_ka&feature=youtu.beでビデオをご覧ください
USERGUIDEは、http://tinyurl.com/gelappでPDFとして利用可能です
*最新の携帯電話など、サムスンノート8にはカメラの保存に問題がある場合があります。そのような問題がある場合は、ギャラリーを使用してください。
引用するには、使用してください:
Sim、Jz。*、Nguyen、pv。*、Lee、Hk。、Gan、Ske。 (2015)。 GELAPP:モバイルゲル電気泳動分析器。 Nature Methodアプリケーションノート。 doi:10.1038/an9643
または、App Storeで直接ソフトウェアに
Sim、JZ、Nguyen、PV、Gan、Ske(2014)Gelapp :DNA&ProT Gel Analyzer V1.2。[モバイルアプリケーションソフトウェア]。 https://play.google.comから取得
このアプリは、シンガポールの科学技術、研究庁、バイオインフォマティクス研究所、トランスフォーショナルリサーチ部門の抗体&製品開発ラボの製品です。
クリエイターは、Sim Jia Zhi氏、Nguyen Phi Vu氏、Samuel Gan博士です。
(ポリインターン)(研究責任者)(アシスタントプリンシパル捜査官)