使用日志缩放的第一个用于分析凝胶(琼脂糖和页面)频段的Android应用
*与Android OS更改一致,请使用ES File Explorer访问本地文件,该文件将扎根驱动器/SD卡。您将需要进入ES File Explorer首先执行生根。请注意,由于Android和Dropbox的变化,Dropbox支持将被删除。
这是第一个允许您使用标记自动生成的日志图分析凝胶(琼脂糖和页面)频段的Android应用。它允许自动检测和加载以供将来使用。使用Gabor过滤器,此应用程序允许用户自动改善频段的检测。对于质量差的图像,用户可以单击可以手动在所需的频段上绘制一个框或单击图像以确定指定位置。
图像可以从画廊或Dropbox加载,从而非常方便。最好的图像是通过扫描仪生成的图像,但可以通过从移动相机拍摄的照片来发挥作用。
照片应在带有凝胶的直接飞机上拍摄。
此应用的功能包括:
1)琼脂糖或页面的规范。
2)页面标记带的颜色识别。
3)高级成像过滤器-Garbor。
4)如有必要,可以使用自定义用户输入的自动图像处理。
5)为未来的便利而节省图像处理的设置。
6)使用相同的标记时节省标记以实现未来的便利性。
7)基于简单和按钮的用户界面。
8)频段自动检测。
9)简单的用户定义边界框。
10)自动生成标记的日志图。
11)用户定义特定频段的位置。
12)与多个平板电脑和智能手机的景观和肖像视图兼容。
13)与分析的凝胶和日志图形智能手机和平板电脑的屏幕截图功能的兼容性。
14)在凝胶图像中显示的读数带有突出显示的框和计算的带尺寸。
15)在分析之前,图像的裁剪功能。
16)编辑功能以删除不需要的频段。
17)用于标记和乐队的不同彩色盒子。
18)简单直接访问图像图像库。
19)与SYBR绿色的ETBR琼脂糖凝胶分析兼容。
20)直接摄像机访问。
将此应用用于出版物的好处
1)为您的凝胶分析带来更高的准确性,而不是依靠近似值。
2)增值增加了出版物和报告。
3)对科学专业的学生有用的教学工具。
4)简化分析,减少人为错误和主观性 - 您现在可以信任受训者和经验不足的员工报告的价值!
5)在使用智能手机/平板电脑的GO分析中。
6)自动分析 - 不需要图形纸和繁琐的绘图。
7)该应用是免费的!
8)该应用程序是独立的,不需要Internet访问(除非进行Dropbox分析)。
Android 6用户可以从本地“图像”画廊获取图像。较早的Android版本用户将支持Dropbox。这是由于Android 6的变化所致,并且无法控制。
要使用的说明,请在https://www.youtube.com/watch?v=chlzhy8d_ka&feature=youtu.be上观看视频。
在http://tinyurl.com/gelapp上以PDF的价格使用USERGUIDE
*最新手机,例如三星Note 8可能会在节省相机方面存在问题。如果存在此类问题,请使用画廊。
引用,请使用:
Sim,Jz。*,Nguyen,Pv。*,Lee,Hk。,Gan,Ske。 (2015)。 Gelapp:移动凝胶电泳分析仪。自然方法应用笔记。 doi:10.1038/an9643
或直接在App Store中的软件
SIM,JZ,NGUYEN,PV,GAN,SKE(2014)GELAPP :DNA和PROT GEL ANALYZER v1.2。[移动应用程序软件]。取自https://play.google.com
该应用程序是新加坡科学,技术和研究机构,生物信息学研究所转化研究部抗体与产品开发实验室的产品。
创作者是:Sim Jia Zhi先生,Nguyen Phi Vu先生和Samuel Gan博士。
(Poly Intern)(研究官)(助理首席研究员)